Глотка
З рота їжа надходить у наступний відділ травної системи риби – глотку. В ній містяться зяброві щілини, які відкриваються назовні. На зябрах є тичинки.
Хижакам вони допомагають утримувати здобич і оберігають від пошкодження зябра. Інші риби через останні відціджують воду і затримують корм. Крім цього, в глотці розташовані залози, що виробляють слиз, що сприяє ковтанню.
Стравохід і шлунок
Глотка переходить у стравохід, який є невеликим органом травної системи риб, що переходить у шлунок, який сприяє просуванню корму. У іглобрюх риб стравохід може роздуватися, наповнюючись повітрям. У акул, скатів і лососів він складається з двох відділів, а у окунів – сліпий відросток. У деяких водних мешканців шлунка зовсім немає, і стравохід змінюється кишечником.
Кишечник
Стравохід переходить в кишечник, який починається з тонкої кишки. В неї впадають два протоки від:
- печінки, що доставляє жовч;
- підшлункової залози з каталізаторами (ферментами).
Ці складові сприяють розщепленню білків до амінокислот, жири в жирні кислоти та гліцерин, полісахаридів в цукру. Поживні речовини після розщеплення всмоктуються в кров через складчасті стінки шлунка, забезпечені виростами і пронизані лімфатичними судинами і капілярами. Особливістю травної системи риб є довжина кишечника. Вона знаходиться в прямій залежності від калорійності їжі. У хижаків він короткий, а у риб, що харчуються планктоном, довгий. Кишечник товстолобика по довжині в 16 разів перевищує його власні розміри. У всіх видів риб він закінчується анальним отвором, розташованим між статевим і сечовим проходом.