Повоєнні роки
Після війни модернізації піддалися технічне обладнання і засоби зв’язку. В 1960 роки оголошений архітектурний конкурс на будівництво нової будівлі пасажирського терміналу, який виграли архітектори Карел Филсак і Карел Бубеничек. Вони також розробили систему трьох злітно-посадкових смуг, найдовша з яких досягала 3200 м. З цієї нагоди площа аеропорту була розширена до 800 га.
Новітній час
У 1989-1993 роки була проведена реконструкція північного крила аеровокзалу. 17 січня 2006 року в дію введено термінал № 2. Нова конструкція привертає увагу витонченими архітектурними формами, а також енергозберігаючими технологіями.
5 жовтня 2012 року аеропорту присвоєно ім’я Вацлава Гавела, який став лідером руху за повалення комуністичного режиму і згодом зайняв посаду президента Чехії. Цій події передувала петиція словацького кінорежисера Феро Фенича, яку за кілька днів підписали 65 000 чоловік.
Модернізація ЗПС дозволила (починаючи з 2016 року) приймати найбільші з існуючих пасажирські лайнери Airbus A380 авіакомпанії Emirates, що курсують за маршрутом Прага – Дубай. Ще однією знаковою подією став приліт найдовшого серійного літака сучасності Boeing 747-8 (76,3 м). Він експлуатується корейською компанією Korean Air і курсує між Прагою і Сеулом.
Також з 2016 в аеропорт прийшли три нові китайські авіалінії:
- China Eastern (Шанхай).
- Hainan Airlines (Пекін).
- Sichuan Airlines (Chengdu).